В 1983 году недалеко от города Лисаковска в обрыве берега реки Тобол школьник Сергей Яцук нашел глиняный горшок. Археологом А. П. Мазниченко на месте находки были обнаружены жилищные впадины поселения эпохи бронзы. Спасательные археологические раскопки Лисаковского комплекса были начаты в 1985 году. Первоначально они финансировались Лисаковским горно-обогатительным комбинатом (директор Е. Т. Зябрев, заместитель директора А. А. Греф, 1985–1989 гг.). С 1990 года средства на археологические исследования выделялись городскими властями (Лисаковский горисполком, Фонд экономического и социального развития Лисаковской специальной экономической зоны, Фонд экономического и социального развития г. Лисаковска, городской бюджет). В последние годы (2005–2012 гг.) археологические работы осуществлялись при финансовой поддержке Управления культуры акимата Костанайской области.

Лисаковская археологическая экспедиция была сформирована на базе Карагандинского государственного университета имени академика Е. А. Букетова. Первые исследования поселения провел карагандинский археолог В. В. Варфоломеев в 1985 году. В дальнейшем исследования лисаковских археологических древностей возглавила сотрудник КарГУ Э. Р. Усманова (1986–2017 гг.). Полевые исследования осуществлялись археологом А. С. Сусловым, ведущим научным сотрудником Лисаковского музея истории и культуры Верхнего Притоболья (2000–2012 гг.).

В 1986–1992 гг. в раскопках принимали участие студенты КарГУ имени академика Е. А. Букетова, в 1993–1996 гг. – студенты Евразийского государственного университета имени Л. Н. Гумилева, в 1997–1999 гг. – студенты Костанайского государственного университета имени А. Байтурсынова. Лисаковская археологическая экспедиция популярна среди людей, которым интересна история древних культур Евразийской степи. В течение двадцати пяти лет на археологические раскопки приезжали волонтеры, студенты, учащиеся из Москвы, Казани, Таллинна, Уфы, Львова, Киева, Днепропетровска, Костаная, Алматы, Караганды, Темиртау, Жезказгана, Сатпаева. Раскопки посетили граждане Дании, Великобритании, США и Чили. За годы работы Лисаковской археологической экспедиции в ее составе побывало около 400 человек.

Лисаковская археологическая экспедиция носит комплексный характер. В ней работали специалисты-археологи из Караганды и Москвы (Российская Академия Наук), почвоведы и геологи (Московский государственный университет имени М. В. Ломоносова, институт почвоведения имени В. В. Докучаева). Были осуществлены совместные проекты с археологами и специалистами из  университетов Экстера (Великобритания), Аризоны, Питтсбурга (США) – 2004–2009 гг.

Доклады и сообщения об открытиях Лисаковской археологической  экспедиции были представлены на научных конференциях, совещаниях и конгрессах в Москве, Алматы, Астане, Челябинске, Кемерово, Санкт-Петербурге, Томске, Барнауле. В странах дальнего зарубежья: Сегед, Будапешт (Венгрия), Оксфорд, Экстер (Великобритания), Измир, Стамбул (Турция), Университет Аризоны (США), Хиросима (Япония).

В результате  археологических раскопок поселения и семи некрополей в районе города Лисаковска, некрополя у села Новоильиновки была получена объемная информация по истории сообществ эпохи бронзы, ранних и поздних кочевников. Опубликовано около сотни статей, пять монографий, пять статей в международных журналах с повышенным импакт-фактором (индекс цитированности). Научная интерпретация материалов археологических памятников Лисаковской округи осуществлена учеными из разных стран: Казахстан – Э. Р. Усманова, В. В. Варфоломеев, В. Г. Ломан, А. В. Колбина, А. М.Сеитов, А. С. Суслов, В. В. Воловинский; Россия – С. Г. Боталов, А. В. Епимахов, А. Д. Таиров, А. Г. Акулов, А. К. Каспаров, И. В. Рудковский, Л. Л. Гайдученко, В. Н. Логвин; Великобритания – Алан К. Оутрам, Рената Петерс, Гаруда Эшли, Смирниоу Мелина; США – И. П. Панюшкина, Барбара Миллс, Алиша Вентреска-Миллер.

Коллекция артефактов, собранная за годы археологических исследований (1985–2012 гг.) стала основой для создания Лисаковского музея истории и культуры Верхнего Притоболья.

На протяжении многих лет городские власти Лисаковска оказывали активное содействие работе археологов. Особо хочется отметить городских  руководителей: В. П. Коваленко, А. П. Заику, А. П. Шпака, А. П. Рау, В. А. Полешко; работников городской  администрации Л. Г. Лескову, В. В. Абоимову, С. П. Шульгу, Н. К. Молдабаеву. Большое участие в организации жизни экспедиции принимал Лисаковский технический колледж (Ю. Ф. Шаврин, Г. В. Будкевич). Городские газеты «Лисаковская новь», «Бизнес-пресс», городское телевидение «Акцент» и радио «Рауан» профессионально освещали работу экспедиции.

Археологи Лисаковской экспедиции всегда ощущают заботу жителей города Лисаковска. Помощь в работе оказывали и лисаковские бизнесмены: В. М. Зайцев, Н. В. Распертов, В. Е. Кашурников. Благодаря всенародной поддержке молодой  город Лисаковск обрел иную историю – древнюю.